モール系サイトに出店している自店舗の価格は、必ず取得できるわけではありません。
下記の手順で、自店舗が取得できていない理由を判断してください。

1. 適切な価格調査条件が設定されているか

プライスサーチでは、商品編集の画面にある【確認】ボタンをクリックすると遷移するページから、価格データを取得しています。　詳しくは こちら

まずは、遷移先のページ（=価格調査するページ）で、自店舗が検索結果に表示されているかを確認してください。
自店舗が検索結果に表示されない場合は、価格調査条件を修正して自店舗がヒットするようにしてください。

※在庫がない商品は、調査先サイト側の検索結果一覧に表示されないので、データを取得できません。

2. 自店舗が何件目に表示されているか

商品編集の【確認】ボタンから遷移したページで、自店舗が検索結果に表示されている場合、自店舗が何件目に表示されているかを確認してください。

モール系サイトの場合、通常では「商品価格」が安い順に上位20件まで の価格データを取得します。　詳しくは こちら
そのため、上位20件目までに自店舗が含まれていないと、取得することができません。
自店舗の「商品価格」が安い順での順位が上がれば、データを取得できるようになります。

例えば、商品編集の画面で楽天市場の価格調査条件の【確認】ボタンをクリックすると、以下のようなページに遷移します。
検索結果では52件ヒットしていますが、プライスサーチで取得するのは「商品価格」が安い順に上位20件目までとなります。